Цель создания Центра – охрана здоровья матери и ребенка, укрепление репродуктивного здоровья населения, совершенствование службы планирование семьи и медико-генетического консультирования, уменьшение репродуктивных потерь, снижение заболеваемости беременных женщин и новорожденных детей, улучшение демографических показателей, разработка и реализация основных научных направлений по сохранению и укреплению здоровья женщин и детей.